较之激光、等离子、线切割等传统的切割方式，数控水切割机确实有其独特、显著的优势：
1）数控水刀切割与激光切割比较
激光切割设备的投资较大，目前大多用于薄钢板、部分非金属材料的切割，切割速度较快，精度较高，但激光切割时在切缝处会引起弧痕并引起热效应；另外对有些材料激光切割不理想，如铝、铜等有色金属、合金，尤其是对较厚金属板材的切割，切割表面不理想，甚至无法切割。目前人们对大功率激光发生器的研究，就是力图解决厚钢板的切割，但设备投资、维护保养和运行消耗等成本也很可观。水刀切割投资小，运行成本低，切割材料范围广，效率高，操作维修方便。
2）数控水刀切割与等离子切割比较
等离子切割有明显的热效应，精度低，切割表面不容易再进行二次加工。水刀切割属于冷态切割，无热变形，切割面质量好，无须二次加工，如需要也很容易进行二次加工。
3）数控水刀切割与线切割比较
对金属的加工，线切割有更高的精度，但速度很慢，有时需要用其它方法另外穿孔、穿丝才能进行切割，而且切割尺寸受到很大局限，水刀切割可以对任何材料打孔、切割，切割速度快，加工尺寸可选余地大。
4）数控水刀切割与其它切割方法比较
对一些金属零件可采取冲剪工艺方法，效率高、速度快，但需要特定的模具和刀具，水刀切割与该切割方法相比柔性好，可随时进行任意形状工件的切割加工，尤其在材料厚、硬度高等情况下，冲剪工艺将很难或无法实现，而用水刀切割方法则较为理想；火焰切割也是金属领域常用的切割工艺，切割的厚度范围非常大，但与水刀切割相比其热效应明显、切割表面质量和精度较差，另外水刀切割能很好地解决一些熔点高、合金、复合材料等特殊材料的切割加工。
在玻璃、石材、陶瓷等切割加工行业，传统的方法是用金刚石刀具进行切、锯、铣等，切割的厚度范围非常大、速度较快，但对常规厚度的板材，数控水切割机可进行高精度的任意曲线的切割加工，成品率高，降低生产成本，且大大提高加工产品的附加值。
